Thymian ist ein wichtiges Gewürz zahlreicher europäischer Küchen, vor allem in Südeuropa. Es ist speziell typisch für Frankreich, wo man knackige Thymianzweige mit anderen Kräutern zu Bündeln bindet und Suppen, Saucen oder Eintöpfen zusetzt. In der mitteleuropäischen Küche eingesetzt man Thymian zumeist für Suppen, Fisch, Geflügel und Eier.

Ebenso verbessert Thymian, ausgesprochen Zitronenthymian, jeden Kräuteressig. Zusammen mit Majoran wird Thymian für Wurstgewürzmischungen eingesetzt. Ebenso Hartkäse werden Mit Thymian aromatisiert.