Thymian ist ein wichtiges Gewürz vieler europäischer Küchen, vor allem in Südeuropa. Es ist besonders typisch für Frankreich, wo man frische Thymianzweige mit anderen Kräutern zu Bündeln bindet und Suppen, Saucen oder Eintöpfen zusetzt. In der mitteleuropäischen Küche verwendet man Thymian zumeist für Suppen, Fisch, Geflügel und Eier. Ebenso verbessert Thymian, besonders Zitronenthymian, jeden Kräuteressig. Zusammen mit Majoran wird Thymian für Wurstgewürzmischungen verwendet. Auch Hartkäse werden Mit Thymian aromatisiert.